实施内部项目审计时应进行的工作有以下七大部分：编制项目审计方案、下发审计通知书、收集审计证据、编制审计工作底稿、结果沟通、出具审计报告和安排后续审计。

一、编制项目审计方案

审计项目负责人应当根据被审计单位的情况编制项目审计方案，应考虑的情况有：业务活动概况；内部控制、风险管理体系的设计及运行情况；财务、会计资料；重要的合同、协议及会议记录；上次审计结论、建议及后续审计情况；上次外部审计的审计意见；其他与项目审计方案有关的重要情况。

项目审计方案的基本内容包括：被审计单位、项目的名称；审计目标和范围；审计内容和重点；审计程序和方法；审计组成员的组成及分工；审计起止日期；对专家和外部审计工作结果的利用；其他有关内容。

二、下发审计通知书

内部审计机构应当根据经过批准后的年度审计计划和其他授权或者委托文件编制审计通知书。在实施审计三日前，向被审计单位或者被审计人员送达审计通知书。特殊审计业务的审计通知书可以在实施审计时送达。

审计通知书的内容应当包括：审计项目名称；被审计单位名称或者被审计人员姓名；审计范围和审计内容；审计时间；需要被审计单位提供的资料及其他必要的协助要求；审计组组长及审计组成员名单；内部审计机构的印章和签发日期。

三、收集审计证据

内部审计人员应当依据不同的审计事项及其审计目标，获取不同种类的审计证据。审计证据种类主要包括：书面证据；实物证据；视听证据；电子证据；口头证据；环境证据。

内部审计人员向有关单位和个人获取审计证据时，可以采用（但不限于）的方法有：审核；观察；监盘；访谈；调查；函证；计算；分析程序。

四、编制审计工作底稿

审计工作底稿是指内部审计人员在审计过程中所形成的工作记录，编制审计工作的目的有：为编制审计报告提供依据；证明审计目标的实现程度；为检查和评价内部审计工作质量提供依据；证明内部审计机构和内部审计人员是否遵循内部审计准则；为以后的审计工作提供参考。

审计工作底稿主要包括下列要素：被审计单位的名称；审计事项及其期间或者截止日期；审计程序的执行过程及结果记录；审计结论、意见及建议；审计人员姓名和审计日期；复核人员姓名、复核日期和复核意见；索引号及页次；审计标识与其他符号及其说明等。

五、结果沟通

内部审计机构应当在审计报告正式提交之前与被审计单位、组织适当管理层进行认真的、充分的沟通，听取其意见。结果沟通主要内容包括：审计概况；审计依据；审计发现；审计结论；审计意见；审计建议。

六、审计报告

内部审计人员应当在审计实施结束后，以经过核实的审计证据为依据，形成审计结论、意见和建议，出具审计报告。如有必要，内部审计人员可以在审计过程中提交期中报告，以便及时采取有效的纠正措施改善业务活动、内部控制和风险管理。审计报告主要要素有：标题、收件人、正文、附件、签章、报告日期等。

审计报告的正文主要包括下列内容：

（一）审计概况，包括审计目标、审计范围、审计内容及重点、审计方法、审计程序及审计时间等；

（二）审计依据，即实施审计所依据的相关法律法规、内部审计准则等规定；

（三）审计发现，即对被审计单位的业务活动、内部控制和风险管理实施审计过程中所发现的主要问题的事实；

（四）审计结论，即根据已查明的事实，对被审计单位业务活动、内部控制和风险管理所作的评价；

（五）审计意见，即针对审计发现的主要问题提出的处理意见；

（六）审计建议，即针对审计发现的主要问题，提出的改善业务活动、内部控制和风险管理的建议。

被审计单位对审计报告有异议的，审计项目负责人及相关人员应当核实，必要时应当修改审计报告，然后连同被审计单位的反馈意见及时报送内部审计机构负责人复核、归档。

七、后续审计

后续审计，是指内部审计机构为跟踪检查被审计单位针对审计发现的问题所采取的纠正措施及其改进效果，而进行的审查和评价活动。内部审计机构可以在规定期限内，或者与被审计单位约定的期限内实施后续审计，审计项目负责人应当编制后续审计方案，对后续审计做出安排。编制后续审计方案时应当考虑的因素有：审计意见和审计建议的重要性；纠正措施的复杂性；落实纠正措施所需要的时间和成本；纠正措施失败可能产生的影响；被审计单位的业务安排和时间要求。最后，内部审计人员应当根据后续审计的实施过程和结果编制后续审计报告。